La réforme de la facture électronique entre progressivement en vigueur et va transformer en profondeur les pratiques de facturation de toutes les entreprises, même votre exploitation agricole.

Au-delà d’une simple obligation réglementaire, il s’agit d’un véritable changement dans la gestion quotidienne de votre exploitation agricole. Anticiper dès maintenant vous permettra d’aborder cette transition plus sereinement.

Les dates à retenir

À compter du 1er septembre 2026,

  • Réception obligatoire pour toutes les entreprises,
  • Émission selon taille (grandes entreprises puis PME/TPE au 1er septembre 2027).

À partir du 1er septembre 2027, vous devrez également :

  • Émettre toutes vos factures au format électronique,
  • Transmettre vos données de ventes à l’administration fiscale via cette même plateforme.

Qu’est-ce qui change pour votre exploitation agricole ?

Tout d’abord, pour vos clients professionnels (coopératives, négociants, autres agriculteurs…), la facture électronique devient obligatoire et devra obligatoirement transiter par une plateforme agréée.

Ensuite, pour vos clients particuliers (vente directe, marchés…), il faudra toujours émettre une facture qui sera envoyée par le canal de votre choix. Vous devrez réaliser un e-reporting afin de déclarer vos ventes à l’administration fiscale.

Certaines situations spécifiques existent :

  • Entraide agricole : pas d’obligation, sauf en cas d’option à la TVA (opérations exonérées)
  • Pêche en haute mer : pas d’obligation, sauf option TVA
  • Micro-entrepreneur agricole : vous êtes concerné par la réforme

Ce que vous devez faire dès maintenant

Étape 1 : Vérifier votre système de facturation

  • Contactez votre fournisseur de logiciel
  • Assurez-vous qu’il est compatible « facture électronique »
  • Échangez avec votre comptable Cerfrance Alliance Centre si besoin

Étape 2 : Choisir une plateforme agréée

Cerfrance Alliance Centre vous conseille Effinum, la plateforme agréée du réseau Cerfrance.

Étape 3 : Former votre équipe

  • Prévoir environ 2 heures de formation par personne
  • Créer un mémo simple et opérationnel
  • Formaliser les nouveaux processus de facturation

Étape 4 : Tester votre organisation avant l’été 2026

  • Réalisez des tests avec des factures fictives
  • Vérifiez le bon fonctionnement de votre système
  • Récupérez les adresses électroniques de facturation de vos clients « professionnels »

Points d’attention

Certaines situations nécessitent une vigilance particulière :

  • Acomptes : une facture d’acompte (avec HT et TVA) doit être émise, suivie d’une facture de solde faisant référence à celle-ci.
  • Importations (graines, intrants…) : elles doivent être déclarées via votre plateforme agréée.
  • Multiplicité des logiciels : assurez-vous que tous vos outils sont compatibles avec la réforme.
  • Prestations de services : chaque encaissement doit être déclaré sur la plateforme.

Concrètement, qu’est-ce que cela change au quotidien ?

Avant

  • Factures encore parfois au format papier
  • Classement manuel
  • Risques d’erreurs
  • Temps administratif important
  • Archivage physique
  • Transmission manuelle à votre comptable

Après

  • Automatisation des processus
  • Envoi automatique des factures
  • Amélioration de la trésorerie
  • Réduction des erreurs
  • Gain de temps significatif
  • Archivage numérique sécurisé
  • Avec Effinum, transmission directe à votre comptable

En conclusion

Ainsi la facture électronique ne doit pas être perçue uniquement comme une contrainte, même pour votre exploitation agricole. Bien préparée, elle représente une opportunité de modernisation et de gain d’efficacité pour votre activité.

Vous avez des questions ? Contactez votre comptable Cerfrance Alliance Centre et participez à nos webinaires dédiés à la facture électronique et à la plateforme agréée Effinum.

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